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【関連論文】腸内細菌・FMT研究まとめ(2025.10.30)

<目次>

・都市化が小型哺乳類群集と腸内細菌叢の相互作用に及ぼす影響の探索

・関節リウマチリスクを有する個人の腸内細菌叢の動態:横断的および縦断的観察研究

・腸内細菌叢由来のリン脂質は腸内遺伝子発現を調節し、抗生物質治療の影響を打ち消す可能性がある

・全身性強皮症における糞便微生物移植は、いよいよ本番を迎える段階にあるのでしょうか?

・糞便微生物叢移植は腸内細菌叢と代謝プロファイルを調節することで放射線腸炎を軽減する

・長年にわたるヨーグルト摂取と腫瘍内ビフィズス菌量による大腸がん発症率のサブクラス分類 

・β-ヒドロキシ酪酸はヒト網膜色素上皮ARPE-19細胞における高グルコースの有害な影響を緩和する

・メトホルミンによる循環系から腸管腔へのグルコースフラックスの調節 

・小児期の機能性便秘の有病率と日々の歯磨き頻度の前向き関連:子どもの健康と環境に関する全国調査

・糞便微生物叢移植の現在の応用と将来展望

・細菌由来の3-ヒドロキシドデカン酸がGPR84受容体を介して強力な抗腫瘍免疫応答を誘導する

都市化が小型哺乳類群集と腸内細菌叢の相互作用に及ぼす影響の探索

(タイトル) Exploring the potential effects of forest urbanization on the interplay between small mammal communities and their gut microbiota

(タイトル訳) 都市化が小型哺乳類群集と腸内細菌叢の相互作用に及ぼす影響の探索

(概要)都市化は野生動物の生息環境に大きな影響を与え、適応可能な種とそうでない種の分布を変化させる。この研究では、小型哺乳類の腸内細菌叢(GM)が都市環境への適応に果たす役割を検証した。都市化による影響を評価するため、森林環境に生息する小型哺乳類の腸内細菌叢の組成を16Sメタバーコーディング法で解析した。その結果、都市環境に適応した種(urban adapters )と都市環境に特化した種(urban dwellers)では、腸内細菌叢の多様性と機能に違いがあることが示された。特に、都市環境に適応した種では、機能的冗長性が高く、腸内細菌の組成が比較的安定しているのに対し、都市特化種では細菌の多様性が低く、機能的な多様性が高かった。これらの結果は、腸内細菌叢が小型哺乳類の都市環境への適応に重要な役割を果たしている可能性を示唆している。

(著者)Marie Bouilloud, Maxime Galan, Julien Pradel, Anne Loiseau, Julien Ferrero, Romain Gallet, Benjamin Roche, Nathalie Charbonnel

(所属)CBGP, IRD, CIRAD, INRAE, Institut Agro, Univ Montpellier, Montpellier, France

MIVEGEC, IRD, CNRS, Univ Montpellier, Montpellier, France

Centre de Biologie pour la Gestion des Populations, 750 Avenue Agropolis, 34988 Montferrier sur Lez, France

(雑誌名・出版社名)Animal Microbiome

(出版日時)2024年3月25日

DOI:https://doi.org/10.1186/s42523-024-00301-y

URL:https://animalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s42523-024-00301-y

関節リウマチリスクを有する個人の腸内細菌叢の動態:横断的および縦断的観察研究

(タイトル)Dynamics of the Gut Microbiome in Individuals at Risk of Rheumatoid Arthritis: A Cross-Sectional and Longitudinal Observational Study

(タイトル訳)関節リウマチリスクを有する個人の腸内細菌叢の動態:横断的および縦断的観察研究

(概要)関節リウマチ(RA)発症におけるPrevotellaceaeの存在に関する相反する報告を解決し、RAの進行者と非進行者における腸内細菌叢の構造、機能、時間的変化を観察することを目的としている。抗環状シトルリン化ペプチド(anti-CCP)抗体陽性で関節炎を発症していない124名を対象とし、16S rRNAシーケンスとショットガンメタゲノム解析を用いて腸内細菌の構成と代謝機能を評価している。その結果、RA進行群ではPrevotellaceaeの特定菌株が増加し、腸内細菌叢の不安定化が発症約10ヶ月前に始まることが明らかとなった。関節炎発症中の腸内細菌叢の構造変化は、アミノ酸代謝の増加と関連していた。RAのリスクを抱える人々はPrevotellaceaeの過剰増殖を含む(ただしそれに限定されない)独特な腸内細菌叢を抱えていることが示された。

(著者)Christopher M. Rooney, Ian B. Jeffery, Kulveer Mankia, Mark H. Wilcox, Paul Emery

(所属)Leeds Institute of Medical Research, University of Leeds, Leeds, UK c.rooney@leeds.ac.uk.

4D Pharma PLC, Cork, Ireland.

University of Leeds, Leeds Institute of Rheumatic and Musculoskeletal Medicine, Leeds, UK.

NIHR Leeds Musculoskeletal Biomedical Research Centre, Leeds, UK.

Leeds Institute of Medical Research, University of Leeds, Leeds, UK.

(雑誌名・出版社名)Annals of the Rheumatic Diseases

(出版日時)2025年1月22日

DOI:10.1136/ard-2024-226362

URL:https://ard.eular.org/article/S0003-4967(24)14845-5/fulltext

腸内細菌叢由来のリン脂質は腸内遺伝子発現を調節し、抗生物質治療の影響を打ち消す可能性がある

[Preprint]

(タイトル) Gut Microbiota Phospholipids Regulate Intestinal Gene Expression and Can Counteract the Effects of Antibiotic Treatment

(タイトル訳) 腸内細菌叢由来のリン脂質は腸内遺伝子発現を調節し、抗生物質治療の影響を打ち消す可能性がある

(概要)本研究では非肥満糖尿病(NOD)マウスを用いて幼少期の抗生物質への曝露が腸内微生物叢を再構築し、代謝に影響を与え、1型糖尿病(T1D)の発症を加速させることを明らかにしている。さらに、抗生物質曝露が腸内細菌叢の脂質代謝に及ぼす影響を解析し、微生物由来のリン脂質が炎症を抑制する可能性を示している。マウスとヒトのデータを比較し、抗生物質による脂質プロファイルの変化と、それを回復させる盲腸内容物移植(CMT)の効果を確認している。さらに、特定のリン脂質がNF-κB経路を介して抗炎症作用を示し、1型糖尿病(T1D)の発症に関与する遺伝子発現を抑制することを明らかにした。

(著者)Xue-Song Zhang, Yujue Wang, Haipeng Sun, Christa Zerbe et al.

(所属)Center for Advanced Biotechnology and Medicine, Rutgers University

Metabolomics Shared Resource, Rutgers Cancer Institute

Department of Biochemistry and Microbiology, Rutgers University

Clinical Center and NIAID, National Institutes of Health

Department of Medicine, Robert Wood Johnson Medical School, Rutgers University

(雑誌名・出版社名) bioRxiv

(出版日時) 2025年1月28日

DOI:https://doi.org/10.1101/2025.01.28.633906

URL:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.01.28.633906v1

(コメント)失われてゆく、我々の内なる細菌のMartin J. Blaserが著者にいます。

全身性強皮症における糞便微生物移植は、いよいよ本番を迎える段階にあるのでしょうか?

(タイトル)Is Faecal Microbiota Transplantation Ready for Prime Time in Systemic Sclerosis?

(タイトル訳)全身性強皮症における糞便微生物移植は、いよいよ本番を迎える段階にあるのでしょうか?

(概要)全身性強皮症(SSc)に伴う消化管疾患は高い罹患率と死亡率を伴い、治療法が限られている。SSc患者ではディスバイオシスが認められ、これが消化管症状と関連する可能性が示唆されている。また、無症候性のSSc早期患者においても、マノメトリー検査で腸管運動障害が確認されており、腸内細菌叢の変化がSScの病態生理に関与している可能性がある。SScにおける腸内細菌の役割を考慮すると糞便微生物移植(FMT)が新たな治療法となる可能性がある。本論文ではFMTの適用可能性について最新の知見をレビューしている。

(著者)Shu Wen Tay, Andrea Hsiu Ling Low

(所属)Department of Gastroenterology and Hepatology, Singapore General Hospital, Singapore.

Department of Rheumatology and Immunology, Singapore General Hospital, Singapore 169608; Duke-National University of Singapore Medical School, Singapore. Electronic address: andrea.low.h.l@singhealth.com.sg.

(雑誌名・出版社名)The Lancet Rheumatology

(出版日時)2025年1月31日

DOI:10.1016/S2665-9913(24)00376-X

URL:https://www.thelancet.com/journals/lanrhe/article/PIIS2665-9913(24)00376-X/abstract

糞便微生物叢移植は腸内細菌叢と代謝プロファイルを調節することで放射線腸炎を軽減する

(タイトル)Fecal Microbiota Transplantation Alleviates Radiation Enteritis by Modulating Gut Microbiota and Metabolite Profiles

(タイトル訳)糞便微生物叢移植は腸内細菌叢と代謝プロファイルを調節することで放射線腸炎を軽減する

(概要)本研究では糞便微生物叢移植(FMT)が放射線腸炎(RE)の治療に及ぼす影響をラットモデルを用いて検討している。FMTにより腸内細菌叢の調整、炎症の軽減、腸管機能の改善が確認され、特にBlautia wexleraeやRomboutsia timonensisの増加とEnterococcus rattiの減少が観察された。代謝解析では、特にパントテン酸や脂肪酸の変化がFMTの治療効果と関連していた。

(著者)Qin Ding, Jing Xue, Nan Li, Zhihui Hu, Jianbo Song

(所属)Shanxi Bethune Hospital, Shanxi Academy of Medical Sciences, Third Hospital of Shanxi Medical University, Tongji Shanxi Hospital, Taiyuan, China.

Third Hospital of Shanxi Medical University, Shanxi Bethune Hospital, Shanxi Academy of Medical Sciences, Tongji Shanxi Hospital, Taiyuan, China.

Third Hospital of Shanxi Medical University, Shanxi Bethune Hospital, Shanxi Academy of Medical Sciences, Tongji Shanxi Hospital, Taiyuan, China; Shanxi Provincial Key Laboratory for Translational Nuclear Medicine and Precision Protection, Taiyuan, China.

(雑誌名・出版社名)Biomolecules & Biomedicine

(出版日時)2025年2月3日

DOI:https://doi.org/10.17305/bb.2025.11835

URL:https://www.bjbms.org/ojs/index.php/bjbms/article/view/11835

長年にわたるヨーグルト摂取と腫瘍内ビフィズス菌量による大腸がん発症率のサブクラス分類 

(タイトル) Long-term Yogurt Intake and Colorectal Cancer Incidence Subclassified by Bifidobacterium Abundance in Tumor

(タイトル訳) 長年にわたるヨーグルト摂取と腫瘍内ビフィズス菌量による大腸がん発症率のサブクラス分類 

(概要)本研究ではヨーグルト摂取による腫瘍抑制効果が、腫瘍組織内のビフィズス菌量によって異なる可能性を検討している。2 つの前向きコホート研究のデータを用い、腫瘍組織内のビフィズス菌量に基づいて大腸がんを分類し、ヨーグルト摂取との関連を解析した。その結果、長期間にわたり週 2 回以上ヨーグルトを摂取する群では、ビフィズス菌陽性腫瘍の発症リスクが 20%低いことが示された。一方、ビフィズス菌陰性腫瘍ではリスク低下が認められなかった。特に近位結腸がんにおいてこの関連が顕著であった。ヨーグルト摂取が特定の腫瘍サブタイプに対して抗腫瘍効果を持つ可能性を示唆している。 

(著者)Satoko Ugai, Li Liu, Keisuke Kosumi, Hidetaka Kawamura et al.

(所属)Program in MPE Molecular Pathological Epidemiology, Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, and Harvard Medical School, Boston, MA, USA.

Department of Epidemiology, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.

Department of Oncologic Pathology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA, USA.

Department of Surgery, Fukushima Medical University, Fukushima, Japan.

and numerous other research institutions.

(雑誌名・出版社名)Gut Microbes 

(出版日時)2025年2月12日

DOI:https://doi.org/10.1080/19490976.2025.2452237

URL:https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/19490976.2025.2452237?rfr_dat=cr_pub 0pubmed&url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org#abstract

β-ヒドロキシ酪酸はヒト網膜色素上皮ARPE-19細胞における高グルコースの有害な影響を緩和する

(タイトル)β-Hydroxybutyrate Mitigates the Detrimental Effects of High Glucose in Human Retinal Pigment Epithelial ARPE-19 Cells

(タイトル訳)β-ヒドロキシ酪酸は、ヒト網膜色素上皮ARPE-19細胞における高グルコースの有害な影響を緩和する

(概要)高グルコース環境は網膜色素上皮細胞(ARPE-19)にダメージを与え、細胞の生存率や機能を低下させる。本研究ではケトン体の一種であるβ-ヒドロキシ酪酸(BHB)が、この高グルコース誘導性の有害作用を軽減する可能性を検討している。BHBは高グルコースによる細胞の生存率低下や炎症性サイトカイン(IL-8、IL-17)の発現増加を抑制し、創傷治癒やコロニー形成能を部分的に回復させることが示された。これらの結果は、BHBが糖尿病性網膜症などの疾患における治療ターゲットとなる可能性を示唆している。

(著者)Francesca Argentino, Marta Mallardo, Ciro Costagliola, Aurora Daniele, Ersilia Nigro

(所属)CEINGE-Biotecnologie Avanzate Scarl “Franco Salvatore”, Via G. Salvatore 486, 80145, Naples, Italy.

International School of Advanced Studies, Center for Neuroscience, University of Camerino, 62032, Camerino, MC, Italy.

Department of Molecular Medicine and Medical Biotechnology, University of Naples “Federico II”, Via Pansini 5, 80131, Naples, Italy.

Department of Neurosciences, Reproductive Sciences and Dentistry, Eye Clinic, University of Naples “Federico II”, Naples, Italy.

and numerous other research institutions.

(雑誌名・出版社名)Human Cell

(出版日時)2025年2月20日

DOI:https://doi.org/10.1007/s13577-025-01187-x

URL:https://link.springer.com/article/10.1007/s13577-025-01187-x

メトホルミンによる循環系から腸管腔へのグルコースフラックスの調節 

(タイトル) Metformin-Regulated Glucose Flux from the Circulation to the Intestinal Lumen

(タイトル訳) メトホルミンによる循環系から腸管腔へのグルコースフラックスの調節 

(概要)神戸大学大学院医学研究科糖尿病・内分泌内科学部門の小川渉教授、地域社会医学健康科学講座の坂口一彦特命教授らの研究グループは、糖尿病治療薬メトホルミンの作用機構を解析する過程で、「糖(ブドウ糖)が腸へ排出される」という現象を発見し、排出された糖は腸内細菌の栄養として使われるとともに、短鎖脂肪酸という健康維持に重要な物質が産生されることを明らかにしました。

(著者)Kazuhiko Sakaguchi, Kenji Sugawara, Yusei Hosokawa, Jun Ito,et al.

(所属)Division of Diabetes and Endocrinology, Department of Internal Medicine, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan.

Division of Community Medicine and Medical Education, Department of Social/Community Medicine and Health Science, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan.

Laboratory for Pathophysiological and Health Science, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, Kobe, Japan.

Faculty of Informatics, Cyber Informatics Research Institute, Kindai University, Osaka, Japan.

and numerous other research institutions.

(雑誌名・出版社名)Communications Medicine

(出版日時)2025年3月3日 

DOI:https://doi.org/10.1038/s43856-025-00755-4

URL:https://www.nature.com/articles/s43856-025-00755-4

プレスリリース↓

腸への糖排出による人と腸内細菌の新しい共生関係を発見

https://www.kobe-u.ac.jp/ja/news/article/20250303-66415

小児期の機能性便秘の有病率と日々の歯磨き頻度の前向き関連:子どもの健康と環境に関する全国調査

(タイトル) Prospective Association of Daily Toothbrushing Frequency and the Prevalence of Childhood Functional Constipation: The Japan Environment and Children’s Study

(タイトル訳) 小児期の機能性便秘の有病率と日々の歯磨き頻度の前向き関連:子どもの健康と環境に関する全国調査

(概要)東北大学病院顎口腔機能治療部の土谷忍助教らの研究グループは、環境省が実施している子どもの健康と環境に関する全国調査(エコチル調査)の83,660組の母子を対象に、機能性便秘の有無(質問票:ROMEⅢ(注3)を使用。3歳、4歳時点)と、毎日の歯磨き回数(2歳、4歳時点)との関連について解析を行いました。その結果、歯磨き回数が少ない子どもで機能性便秘のリスクが増加することを認めました。

(著者)Masahiro Tsuchiya, Shinobu Tsuchiya, Haruki Momma, Ryoichi Nagatomi, Nobuo Yaegashi, Takahiro Arima, Chiharu Ota, Kaoru Igarashi, Yuichiro Miura; Japan Environment and Children’s Study Group

(所属)Tohoku Fukushi University, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Tohoku University Hospital, Tohoku University Graduate School of Medicine, Tohoku University Hospital Department of Pediatrics, and others.

(雑誌名・出版社名) Scientific Reports

(出版日時) 2025年3月5日

DOI:https://doi.org/10.1038/s41598-025-88562-8

URL:https://www.nature.com/articles/s41598-025-88562-8

プレスリリース↓

ハミガキをする子はおなかの調子もいい~子どもの歯磨き習慣と便秘の関係~

https://www.tohoku.ac.jp/japanese/2025/03/press20250307-01-tooth.html

糞便微生物叢移植の現在の応用と将来展望

[Review Article]

(タイトル)Current Applications and Future Prospects of Fecal Microbiota Transplantation

(タイトル訳)糞便微生物叢移植の現在の応用と将来展望

(概要)糞便微生物叢移植(FMT)は、腸内マイクロバイオームのディスバイオシスを是正する革新的な治療法として注目されており、再発性クロストリジオイデス・ディフィシル感染症(CDI)や潰瘍性大腸炎(UC)への高い有効性が報告されている。本研究は、消化器疾患、免疫チェックポイント阻害剤、アレルギー疾患、中枢神経系疾患へのFMTの応用と、抗生物質併用FMT(A-FMT)の臨床研究結果を概観し、将来の個別化治療に向けた可能性を議論している。

(著者)Dai Ishikawa, Xiaochen Zhang, Akihito Nagahara

(所属)Department of Gastroenterology, Juntendo University School of Medicine, 2-1-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8421, Japan

Innovative Microbiome Therapy Research Center, Juntendo University Graduate School of Medicine, 2-1-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8421, Japan

(雑誌名・出版社名)Juntendo Medical Journal, The Juntendo Medical Society

(出版日時)2025年3月12日

DOI:https://doi.org/10.14789/ejmj.JMJ24-0045-R

URL:https://www.jstage.jst.go.jp/article/ejmj/advpub/0/advpub_JMJ24-0045-R/_article/-char/ja/

細菌由来の3-ヒドロキシドデカン酸がGPR84受容体を介して強力な抗腫瘍免疫応答を誘導する

(タイトル)Bacteria-derived 3-hydroxydodecanoic acid induces a potent anti-tumor immune response via the GPR84 receptor

(タイトル訳)細菌由来の3-ヒドロキシドデカン酸がGPR84受容体を介して強力な抗腫瘍免疫応答を誘導する

(概要)本研究では、細菌由来の代謝物ががん治療の新たな選択肢となる可能性を探るため、腫瘍を有するマウスにおける細菌由来の3-ヒドロキシドデカン酸(3OH Dodeca)の作用を検討している。3OH DodecaはGPR84受容体を介して抗腫瘍効果を発揮し、CD8+ T細胞の腫瘍組織への浸潤および細胞傷害活性を促進することが明らかとなった。さらに、3OH Dodecaは大腸がん(CRC)、黒色腫、肺がんモデルにおいて腫瘍の縮小を引き起こし、5-FUとの併用療法においても有望な効果を示した。ヒトCRC患者の血清解析では、進行がんにおいて3OH Dodecaおよびその関連代謝物の減少が観察された。本研究の結果は、3OH DodecaおよびGPR84受容体ががん治療の新たな標的となる可能性を示唆している。

(著者)Egle Katkeviciute, Anna Bircher, Rocio Sanchez, Martin Schwill, Andrea Dorst, Yasser Morsy, Javier Conde, Nicola Zamboni, Karl Gademann, Michael Scharl, Ana Montalban-Arques

(所属)Department of Gastroenterology and Hepatology, University Hospital Zurich, University of Zurich, Switzerland

Recolony AG, Switzerland

Department of Chemistry, University of Zurich, Switzerland

Department of Molecular and Cellular Gastroenterology, University of Santiago de Compostela, Spain

Institute of Molecular Systems Biology, Federal Institute of Technology Zurich, Switzerland

(雑誌名・出版社名)Cell Reports

(出版日時)2025年3月25日

DOI:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.115357

URL:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(25)00128-7

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